Пункт 56(2) При отсутствии временно или постоянно проживающих, рассчитывается с учётом количества собственников.

Обратите внимание: НЕ ВМЕСТО собственников. Временно или постоянно проживающие не заменяют собой собственников.

Подразумевается, что если есть хоть один зарегистрированный, то собственники не считаются при начислениях.

Не согласна с Вами. В тексте постановления явно и прямо такое не указано и логически (по принципу от обратного) из текста такие выводы не следуют. Правовые акты пишутся так и таким языком, чтобы исключить разные толкования одного и того же. Иными словами, если что-либо прямо (недвусмысленно) не указано в НПА, то, следовательно, это что-либо не может подразумеваться, додумываться.

Нет проживающих в квартире — расчет ведется по количеству собственников (с кого-то надо же брать плату согласно ЖК).
Есть проживающий (щие) — расчет ведется по суммарному количеству = собственники + проживающий (щие).

Лучший и спокойный, удобный для владельцев жилья способ в таких случаях — поставить ИПУ.

Отсутствуешь (не проживаешь временно, постоянно), уважаемый собственник, в своей квартире — неси в УК документы, что живешь, зарегистрирован и платишь за коммунальные услуги в другом месте. В 354-м об этом расписано.

Сначала берем (здесь я приводила аргумент из закона) положение статьи 153 ЖК, далее читаем статью 155 ЖК и добавляем к ним пункт 56(2) и другие необходимые по обстоятельствам пункты 354-го постановления — получаем правило для расчета платы.

Статья 153. Обязанность по внесению платы за жилое помещение и коммунальные услуги
2. Обязанность по внесению платы за жилое помещение и коммунальные услуги возникает у:
<...>
5) собственника помещения с момента возникновения права собственности на такое помещение <...>.

Статья 155. Внесение платы за жилое помещение и коммунальные услуги
11. Неиспользование собственниками, нанимателями и иными лицами помещений не является основанием невнесения платы за жилое помещение и коммунальные услуги. При временном отсутствии граждан внесение платы за отдельные виды коммунальных услуг, рассчитываемой исходя из нормативов потребления, осуществляется с учетом перерасчета платежей за период временного отсутствия граждан в порядке и в случаях, которые утверждаются Правительством Российской Федерации.