Есть три фирмы. Продают товар одна другой с выпиской счетов-фактур.
Законна ли такая цепочка операций:
1. Фирма1 продает Фирме2 товар по цене 10 рублей.
2. Фирма2 продает Фирме3 тот же товар по цене 10 рублей (то есть без наценки).
Как в этом случае ставится НДС к зачету Фирмой2 и Фирмой3? Может ли Фирма2 списать затраты по фактуре на 44 счет?

а что тебя смущает, все тут законно, либо описывай поподробнее,

по поводу 44-го счета не понятен вопрос,
туда вообще коммерческие расходы относят,
если они есть - пожалуйста, а если нет,
то применяется 41-й счет.

..но налоговики начинают копатЬ если видЯт продажу без наЦенки(((...

оформляй часть товара как брак, и продавай со скидкой (надо рассчитать количество, чтобы в результате средняя наценка=0), естественно с оформлением всех актов и справок