организация: ИП
Отчисляем за всех сотрудников НДФЛ и пенсионные
С марта 2009 года один сотрудник ушел в отпуск без сохранения з/п. За него не платили ни НДФЛ, ни пенсионные. Сотрудник вернулся и заявил, что пенсионные отчисления должны быть внесены за пеиод отпуска и даже сам готов возместить их сумму. Возможно ли это? Как это оформить?

Нет зарплаты-нет начислений налогов. С чего же они должны начисляться? А зачем ему это нужно? Странный сотрудник.
Если хотите-начисляйте ему зп и налоги, но тогда получится, что вам надо все отчеты с марта делать уточненные и доплачивать налоги и пени по ним.

А добровольные пенсионные взносы сюда может попробовать "приплести"

За него нужно оплатить пенсионный взнос в любой другой месяц

Что значит:"Сотрудник вернулся и заявил, что пенсионные отчисления должны быть внесены за пеиод отпуска..."? Он что диктует вам что вы должны, а что не должны? Есть база для начисления страховых взносов - есть отчисления, нет базы - нет отчислений! Если ему очень хочется внести деньги на свой накопительный счет, пусть заключает договор дополнительного софинансирования согласно 56-ФЗ и в путь!