Если происходит ситуация, когда Свидетельство о регистрации права собственности на квартиру утеряно, либо без согласия собственника изъято третьими лицами (причем известно какими) - какие действия в данном случае можно предпринять для того, чтобы обезопасить себя от неправомерных действий третьих лиц в отношении данной недвижимости?
Первоначальная консультация в Учреждении Юстиции (есть такой такой "администратор" сидит в зале) дала удручающий результат - было сказано что ничего сделать нельзя. То есть наложить какое-то ограничение на операции с данным объектом недвижимости без присутствия владельца невозможно. То есть теоретически, если злоумышленник подделает доверенности от лица собственника, то он сможет продать квартиру?
Какие есть способы и пути для собственника, который попал в такую ситуацию?

Вы искренне считаете, что "у кого свидетельство - тот только и может продать квартиру"?

Уж если кто-то сможет нарисовать доверенность и печать нотариуса, то ему никакое свидетельство не нужно. Он по этой доверенности что угодно с вашей квартирой сделает. Будет классическое "выбытие помимо воли".

а обратиться в полицию с заявлением, признать утерянный документ недействительным и впоследсвии получить уже новое свидетельство (полагаю с новыми серией и номером), не?

Получить в Управлении Росреестра (то что Вы называете Учреждением юстиции) повторное свидетельство о регистрации. Никаких справок из милиции о краже не нужно. Нужно оплатить пошлину 200 рублей. Старое свидетельство, которое у Вас украли, аннулируют.

Если воспринимаете угрозу как реальную, то регистрируйте залог (ипотеку) на квартиру...
Договоритесь с людьми которым вы доверяете, сделайте с ними договор займа, и в счет обеспечения - залог квартиры.
А чтобы ваша степень доверия к ним была выше, одновременно с подписанием договора займа пусть подпишут и отдадут вам расписку о его возврате без даты, а то войдут в роль...
Желающему отмести у вас квартиру нужно будет сперва разобраться с ипотекой...
Однако, желающий отмести у вас квартиру таким способом, должен быть больным на всю голову...

Залог - абсолютно лишние телодвижения. Если счесть реальным несерьезное предположение, что кто-то нарисует липовую доверенность от собственника, что помешает этому мистическому кому-то нарисовать доверенность и от залогодержателя? На деле ситуация может оказаться банально стандартна - или супруги расплевались и один из них припрятал свидетельство, или один из потенциальных наследников по мере сил препятствует другим оформить наследство. Т.е. угроза незаконного отчуждения попросту надумана.

Получить в Управлении Росреестра (то что Вы называете Учреждением юстиции) повторное свидетельство о регистрации. Никаких справок из милиции о краже не нужно. Нужно оплатить пошлину 200 рублей. Старое свидетельство, которое у Вас украли, аннулируют.

Аннулировать его никак не смогут!!!!! Просто выдадут повторное свидетельство. Можно сдать заявление в канцелярию Управления Росреестра (Державина, 28) в произвольной форме с приобщением его к делу с правоустанавливающими документами. Написать, что свидетельство утеряно и велика (скажем так) вероятность совершения мошеннических действий в отношении квартиры, прошу проводить регистрацию на основании только моего заявления и при личном присутствии.

Ну что за бред Откуда вообще мысли, что свидетельство на руках даёт какое-то право на сделку с квартирой?

1. Если уж злодей умеет рисовать нотариальные доверы, то он её нарисует и сходит получит повторное свидетельство (соответственно, нет смысла похищать свидетельство у собственника).
2. Если нарисована доверенность, то можно сдать документы на отчуждение и не прикладывая свидетельства. У регистратора не будет повода отказать в регистрации сделки/права.

Откуда вообще взялся обычай сдавать свидетельство при регистрации сделки/права, я не понимаю. Закон этого не требует. Я уж молчу про то, что первично не свидетельство, а запись в реестре. И уж если бояться, то подделки записи в реестре (вдруг сотрудник Росреестра просто выкинет из дела несколько документов и положит новые). Вот тут-то действительно будет весело...

Сегодня свидетельство - просто красивая никому не нужная бумажка. В качестве правоудостоверяющего документа обычно требуется свежая выписка из ЕГРП о зарегистрированных правах (а свидетельство может быть и 10-летней давности - ни о чём).