Собственно вопрос- ООО сдает в аренду помещение, находится на УСН 6%. Исчисляется ли налог только с суммы аренды, либо еще и 6% с сумм, уплаченных арендатором на счет организации за потребленные им коммунальные услуги?

Исчисляется.