Хочу начать собственное дело, а увольняться с работы как-то "цыкотно". Можно ли мне совмещать две торговые деятельности?

Я знаю что гослужащим это запрещено, но а вдруг и здесь есть какие-нибудь подводные камни?Вдруг рабодатель узнает...

Можно. Узнает разве что случайно или кто взболтнет. И даже если узнает, ничего криминального, могут только личные с ним непонятки быть.

Если у вашего работодателя есть служба безопасности, то скорее всего он узнает о вашей регистрации через некоторое время. Если ему это не выгодно будет - предется уволится.