Все эти цифры никак не говорят о прибыли. Только об обороте.
Мне интересно, с чего вы взяли, что общественный транспорт должен приносить прибыль?
Нет, его задача не прибыль, а комфортное передвижение пассажиров.
И да, это расходная часть бюджета.
Так оборот и показывает, что метро один из самых (если не самый) востребованных видов транспорта.